本发明公开了一种重载车辆识别方法及系统，包括：采集车辆经过桥梁时主梁结构的振动加速度响应数据；对主梁结构的振动加速度响应数据进行小波分析，识别重载车辆过桥时间，并提取重载车辆小波特征值及过桥车速；将小波特征值和车速输入到预先训练好的重载车辆动态识别神经网络模型，识别车辆荷载。优点：本发明的加速度监测响应数据获取简单稳定，无需位移和应变监测数据，同时相比动态秤重方法具有安装维护简便，成本低廉、对桥梁结构无损的优势；本发明充分挖掘桥梁结构振动加速度数据的时频信息，识别精度高，具有快速准确、实时识别的特点，满足桥梁健康监测系统中重载车辆监测的要求。