本发明涉及一种鉴定抗原特异性TCR或BCR的方法及应用，属于免疫学技术领域。该方法通过将氨基酸以连续的氨基酸团的形式进行分析，构建氨基酸团的理化性质向量，之后进行聚类得到若干标准氨基酸团类别。再将经抗原刺激的抗原样本及对照样本的测序数据进行分析，计算分类后样本中各类氨基酸团的含量，筛选得到具有显著差异并且抗原组含量更高的氨基酸团类别；再与上述CDR3区氨基酸序列进行比对，筛选出含有差异氨基酸团类中氨基酸团的CDR3序列，与其对应的克隆即为抗原特异性克隆。该方法不需要进行体外培养细胞，对于TCR或者BCR测序的数据，只需少量样本，即可准确和快速鉴定出抗原特异的TCR或者BCR，可用于制备用于免疫治疗试剂或药物中。