本发明公开了一种整车所有电控单元固件差分升级方法及系统，其方法包括：在目标车辆的主控单元中存储电子控制单元source固件的备份文件，从网络终端接收电子控制单元差分固件，对所述电子控制单元source固件和电子控制单元差分固件进行还原得到电子控制单元target固件，将所述电子控制单元target固件刷写到目标车辆的各个电子控制单元以实现对其固件升级工作。通过利用主控单元RAM资源比较充足的条件来借助其获得电子控制单元的目标升级固件可可间接实现对ECU固件的差分升级，避免在升级包下载过程中需要下载ECU的整包固件，只需要下载source版本和target版本之间的差分包，降低了下载需求量和升级包的体积，缩短了下载时长和节省了网络数据流量成本，提高了用户的体验感。