本发明公开了一种纳米颗粒分选器件结构，包括二氧化硅基底、纳米领结阵列及平面光波及纳米颗粒，所述二氧化硅基底作为纳米领结阵列的基底，用于吸收激光光场中产生的焦耳热；所述纳米领结阵列设于二氧化硅基底上，用于与激光作用形成局域电场，对纳米颗粒进行捕获和分选；所述平面光波，用于提供光源并与纳米领结阵列作用产生消逝场；所述纳米颗粒，作为被捕获和分选的对象。本发明能够实现对捕获物质的无损伤操控，可以稳定捕获纳米颗粒，并且可以利用纳米领结阵列和纳米颗粒的共振频率分离良好来实现对颗粒的分选。