本发明公开一种全自动豆芽处理方法及装置，包括发芽装筐；将豆品于发芽装置浸泡发芽，并将浸发后的豆豆品装筐处理；豆芽清洗；用于将装筐后的豆芽倾泻出筐并进行水洗；空筐清洗；将放出豆芽后的空筐进行消毒清洗；豆芽装筐；将水洗后的豆芽再次装筐并称重，并将装满豆芽的筐体推至豆芽输送带上；码垛装车；将输送线上的筐体分区码垛，兵通过装车设备运至输送车上；空筐整理；将消毒清洗后的空筐输送至滚筒输送带并整理运回发芽装置。本发明能够实现豆品自发芽至装箱运输的全自动化处理，操作方便，无人工操作，大大推进了国内豆芽生产线的研发进程。