本申请提供了一种通道组的信号指令同步处理方法、系统、设备及存储介质，涉及但不限于通信技术领域，方法包括：将第一主网络节点的第一系统时钟与第一通道组的第一从网络节点的第二系统时钟同步；通过第一主网络节点第一路由表对若干第一从网络节点进行最短路径规划，得到包括若干第一从网络节点的第一传输路径；获取信号指令到达第一传输路径的末端节点的第一传输时长；第一主网络节点根据信号指令的执行周期以及第一传输时长，确定信号指令的第一发送时间段。第一从网络节点根据第一传输时长、已传输的第二传输时长以及下一执行周期的触发时间，确定延时时长。系统、设备及存储介质应用上述方法，能提升从网络节点执行同步的概率。