本发明公开了一种多端口GPON OLT系统及其管理控制方法，其中多端口GPON OLT系统包括采用socket连接方式进行连接的N个独立系统，实现对各个独立系统的统一管理；其中每个独立系统包括一个PON芯片、一个内部集成有switch芯片的CPU以及外围电路；所述的PON芯片通过PCle接口与CPU通信连接，形成一个内部的管理系统；每个独立系统由所述的PON芯片引出x个PON端口，所述的CPU引出y个千兆端口；各个独立系统分别引出一个用于相邻的两个独立系统之间的业务数据交换的高速数据通道，和一个用于与内部switch芯片电连接的SGMII通道，组成内部私有通信通道；N个独立系统堆叠形成一个n*x个PON端口、n*y个千兆端口；将其中一个独立系统作为主系统，其余的独立系统作为从系统。