本发明公开了一种复合酶定向适度水解牛初乳的方法，属于食品领域。本发明通过45‑60℃预热处理促进牛初乳酪蛋白选择性钝化，再加入凝乳酶诱导酪蛋白絮凝，之后加入复合蛋白酶进行复合酶水解处理，再依次经过微滤处理、浓缩、低温巴氏杀菌、冷冻干燥得到牛初乳蛋白肽粉。本发明提出采用复合酶定向水解技术同步实现酪蛋白凝聚和定向水解，开发得到易吸收牛初乳蛋白肽粉。采用该技术获得的牛初乳蛋白肽粉能够保持牛初乳原始营养组成；定向水解酪蛋白，产品易于吸收；适度水解，避免苦味肽等不良风味物质的生成。