本申请提供一种棉花质量追溯系统及棉花质量追溯方法，通过构建棉花采摘、棉花交售、棉花加工、棉花公检应用场景，结合采摘打包自动水杂检测、作业区域计算、棉花预约交售app、籽棉交售、水杂快速检测、开模加工自动匹配等信息自动采集技术，实现棉花质量信息可追溯，通过构建棉花追溯链，通过棉花追溯码，匹配农户、农田和加工厂配套，对整个棉花生产链的上游、中游、下游分析，及时发现关键环节缺失或薄弱的情况，进行精准监管；棉花采摘现场可监控，基于采摘现场信息采集，可视化农户、农田、采棉机分布、采摘效率、安全告警、态势分析。棉花加工流程可以监管，对企业经济规模、加工工艺结构、质量以及投入与产出进行分析。