本发明公开一种跨领域数据库整合和迁移方法及系统，其中整合方法包括：对来自第一领域数据库的各项目，建立对应于第一领域的包含多类元数据的第一数据库，多类元数据包括：自然人元数据、组织元数据、地址元数据、物元数据和事元数据，元数据均具有对应的基础属性表，所述第一数据库包括对应于所述第一领域的各项目的所述多类元数据的基础属性表和至少一类元数据的扩展属性表；对来自第二领域数据库的各项目，建立对应于第二领域的第二数据库；整合所述第一数据库和所述第二数据库，生成统一数据库。针对第一领域和第二领域的项目，都先建立对应于五类元数据的数据库，然后再进行整合，可以使得整合的效果更好，后续再进行其他处理也更便捷。