本发明提供一种反作用飞轮性能参数智能评估系统及其评估方法，其包括上位机、数据采集单元以及多个反作用飞轮，数据采集单元通过其内置通讯转换模块建立上位机与多个反作用飞轮的数据传输通道；由人机界面有序发出测试反作用飞轮相关性能的控制指令，并收集数据采集单元及反作用飞轮传输回来的数据，并把所有收集到的数据传输给上位机，由上位机处理从人机界面收到的原始数据，输出计算结果返回给人机界面，由人机界面把性能参数及曲线以测试报告文本形式输出。应用本发明可以解决现有技术中存在的不足，能够全自动地测量反作用飞轮性能参数，同时具备效率高，测量精准，更规范化，不受主观影响等特点。