本发明公开了一种基于双差集的疫情风险识别算法，包括：每日解析疫情风险区域，获取并存储每一风险区域的经度、纬度和边界范围；将当日所有风险区域和昨日所有风险区域的差集为当日新风险区域并保存；将当日新风险区域与历史日期当天的当日所有风险区域的差集作为第二差集；获取项目工人健康申报记录数据，对于当日上传的项目工人健康申报记录根据当日所有风险区域进行识别，对于历史上传的项目工人健康申报记录根据第二差集进行重识别。本发明根据风险区域名称获取经纬度与风险区域范围，在本地服务完成识别逻辑，基于象限法的西向交点判断，特别地使用了优化的射线法进行范围识别，使风险识别处理逻辑更简单，历史申报记录的重识别过程更快。