本发明的一种农用车辆违法超员载人识别方法及存储介质，其中方法包括获取道路和基站经纬度及覆盖信息，根据实时过车数据，筛选农用车经过卡口信息，根据道路卡口和基站映射关系，提取有农用车经过的卡口对应的基站信令数据，根据手机信令MR信息中的用户经纬度数据，和道路数据做匹配，筛选卡口对应道路上移动的手机用户；提取这些用户信令数据，计算过去一定时间段内用户移动的速度和位置，继续跟踪以上疑似同行用户手机信令数据，在经过卡口一定时间段后，若以上用户继续满足以上同行速度、位置、和人数，则输出为疑似农用车违法超员载人；通过本发明交通管理部门可提前进行排查处理，减少或避免交通事故的发生，同时减轻了交警的巡逻压力。