本发明公开了一种硅基生态功能聚氨酯复合材料及其制备方法，所述硅基生态功能聚氨酯复合材料从上往下依次是由有机硅树脂面层、水性PU中间层、无溶剂发泡粘结层和基布组成；其中有机硅树脂面层赋予材料表面天然抗污性能、亲肤触感，并具有耐高温、耐紫外老化性能；水性PU中间层具有高于硅基材料的强度、韧性，赋予材料更好的耐磨耐刮性能；无溶剂发泡粘结层密度小、回弹性能佳、与布基结合后手感柔软丰满，以上三层的结合赋予材料优良的综合性能。本发明解决了有机硅材料及聚氨酯材料单独使用的局限性，又解决了有机硅与聚氨酯材料界面结合的难题，制得的产品可广泛用于工程装饰、家居、医疗、电子、运动装备等领域。