本发明提供一种阵列侧向仪器的加速度校正方法及校正装置，所述方法包括：对加速度曲线进行频谱分析得到基频f，对加速度a求积分得到速度，对速度求积分得到深度位移S，深度修正的最大值△S作为加速度曲线是否需进行加速度校正的判据；采用加速度曲线的基线拟合算法，动态选取轴向加速度数值队列；动态调整位移的积分区间。本发明通过对加速度曲线的频谱分析，得出校正判据；并且针对使用运动学方程与卡尔曼滤波、分段积分的旧方法提出改进措施，以频谱分析确定加速度变化的基频，以此动态调整轴向加速度的基值求取与积分区间，使得预测更接近真实情况。