本发明涉及异构用户缓存容量的多子系统嵌套编码缓存方法及系统，方法如下：一、源节点执行双子系统划分，得到子系统划分比例；二、中继节点和用户随机缓存部分子文件；三，忽略中继节点缓存容量，用户随机缓存剩余部分子文件；四，源节点执行全文件传输；五，中继节点执行联合设计的分组和零比特填充；六，源节点去中心化编码缓存；七，用户将接收到的子文件经解调、解码后，与步骤二和步骤三用户缓存的子文件异或处理后组合恢复请求文件。本发明利用感知的系统信息，将整个传输过程动态划分为两个子系统，并通过调整两个子系统的权重，降低整体的链路负载。