本发明公开了一种水利工程用水轮去污系统，包括转动柱，所述转动柱沿其周向等间距设置有多个连接杆，每个所述连接杆远离转动柱的端均固定连接有阻力叶片，每个所述阻力叶片的位于其顺时针方向的一侧均开设有阻力槽，每个所述阻力槽内壁上均设置有导温层，每个所述导温层内均安装有多个电热丝；其中一个所述连接杆内矩形腔，所述矩形腔内设置有重力运动单元，所述重力运动单元包括滑动连接在矩形腔内的活塞板。该系统中，设置有定量触发模块和电热丝，可以在水轮转动一定圈数后，让电热丝自动启动一段时间后关闭，使得黏性物质的黏性降低，容易被水流冲除，且还设置有导温刮条，可以进一步的提高对黏性物质的去除。