本发明公开了一种多级灭菌器及其灭菌方法，属于灭菌器技术领域，通过支撑转杆的旋转带动侧支撑板，从而使其放置瓶在灭菌仓内旋转进行高温蒸汽灭菌，并通过高温蒸汽回收管和出气罩将高温蒸汽回收至高温蒸汽回收存储仓内通过中空过滤网管过滤后再次进入至弓型加热管内进行加热，以此循环进行高温蒸汽的灭菌，在需要对高温蒸汽进行回收的时候，打开阀门并向阀门内通入清水，使其清水通过竖向连接管进入至中空过滤网管内分布，然后高温蒸汽再次通过中空过滤网管进行过滤并降温液化回收，在中空过滤网管内高温换热后的热水可进行放出再利用。