本申请公开了一种脉动真空灭菌器，包括：灭菌箱壳体、显示仪表板、密封门、灭菌腔室，收纳框体、多根支撑环体；灭菌箱壳体第一侧壁上设置显示仪表板，灭菌箱壳体第一侧壁中心处开设灭菌腔室，灭菌腔室为圆柱腔体；灭菌腔室开设于灭菌箱壳体第一侧壁上为敞口，密封门与灭菌箱壳体铰接；密封门密封盖设于灭菌腔室敞口处；收纳框体为圆柱体，体积小于灭菌腔室内腔体积，收纳框体可容纳放置于灭菌腔室内；收纳框体内部中空，收纳框体的相对两端均为敞口；通过在灭菌器的灭菌腔内设置与灭菌腔体形状相同的收纳框体，便于固定玻璃器皿位置，防止相互接触造成冷凝水汇聚形成难以清理的水渍，还能保护玻璃器皿，防止相互碰撞，提高灭菌处理效率。