本实用新型涉及一种脉动真空灭菌器，脉动真空灭菌器包括灭菌仓体、为灭菌仓体提供热量的加热装置，脉动真空灭菌器还包括设于灭菌仓体外侧的保温夹套，保温夹套与灭菌仓体之间形成有间隔区间，加热装置设于间隔区间内，加热装置能够在间隔区间内进行加热并产生蒸汽，间隔区间能够与灭菌仓体的内部连通，且间隔区间产生的蒸汽能够进入灭菌仓体的内部；本实用新型的结构设计，只需采用一套加热装置，设备整体结构更简单，设备制作成本更低，而且保温夹套包裹在灭菌仓体外周，从而能够提高加热装置对灭菌仓体的加热效果，加热更快，在烘干阶段，可以充分利用间隔区间内蒸汽余热，从而大幅降低加热能耗，节约能源。