本发明提供一种甲磺酸艾日布林关键中间体异构体的制备方法，包括以下步骤：(1)化合物1在盐酸、甲醇条件下转化为化合物2；(2)化合物2在三氟化硼乙醚作用下与三甲基烯丙基硅烷反应得到化合物3；(3)化合物3通过Dess‑Martin氧化反应生成化合物4；(4)化合物4在双(三甲基硅烷基)氨基钾作用下与对甲苯磺酰甲基磷酸二乙酯反应生成化合物5；(5)化合物5在三甲基碘硅烷作用下脱除苄基保护基得到化合物6；(6)化合物6在四丁基氯化铵和三乙酰基硼氢化钠还原条件下生成化合物7。该方法得到的异构体纯度较高，可以满足结构鉴定、杂质谱研究和方法学验证的要求，并且各步反应条件温和、易于纯化、操作简单、收率较高，规避了大量富集并使用液相制备获得，降低了成本。