本发明公开了一种卫星导航接收机主动防电磁干扰与毁伤的方法，该方法依据卫星导航接收机的特性，利用间歇工作的方式，缩短卫星导航接收机电路在电磁空间中暴露的时间窗口，来实现主动防电磁干扰与毁伤的目的，通过主动防护电路实现接收天线与卫星导航接收机电路的断开和连通，实现间歇工作；连通状态进行信号接收；接收完成后转换为隔离保护状态，降低卫星导航接收机暴露在强电磁干扰与毁伤环境下的时间，保证系统在受到电磁干扰、攻击的情况下，最大程度上降低整个系统受电磁波威胁的影响，实现主动防电磁干扰与毁伤的目的，通过此方法可保证卫星导航接收机在不影响导航定位能力的同时，接收机在大部分时间内处于自我保护状态。