本发明公开了阿帕鲁胺杂质的分离方法，涉及医药化工技术领域，阿帕鲁胺杂质的分离方法，其根据阿帕鲁胺化合物晶体进行杂质分离的，该阿帕鲁胺杂质的分离方法，步骤一、准备原材料和试剂，步骤二、进行样品处理，步骤三、样品的分离以及提纯，步骤四、样品的保存。本发明通过乙酸乙酯、乙醇、异固醇、水分液的添加制作以及阿帕鲁胺的存储，从而优化合成步骤以及反应条件，从而使阿帕鲁胺的合成周期缩短，并且明确关键工艺参数以及产品的质量标准，使得阿帕鲁胺去杂质工艺过程中能够快速把握关键控制点，有助于阿帕鲁胺去杂质能够高效稳定进行，从而便于阿帕鲁胺进行大量生产。