本发明涉及一种灭菌器水循环系统，包括锅体、蒸发器和集水器，锅体上设有进气口和第一排水口，蒸发器上设有排气口，集水器上设有第一进水口，排气口与进气口通过第一管路连通，第一排水口与第一进水口之间通过第二管路连通，第二管路上设有第一电磁阀，集水器与蒸发器之间通过回水管路连通，由蒸发器通过第一管路向锅体提供水蒸气，而锅体内的水蒸气冷凝后经第二管路送至集水器中，再由集水器通过回水管路将冷凝水送回至蒸发器中加热二次利用，整体用水量大大减少，即使是在长时间持续灭菌时，仍然能够在不额外添水的情况下持续产生水蒸气，以解决现有技术中灭菌器灭菌时耗水量大，长时间灭菌有效性低的技术问题。