本发明涉及一种融合人工电磁超构材料的电磁频率信号分离导波结构，该导波结构包括第一传输层和第二传输层，两层结构为上下两层，每个传输层支持不同传输频率的电磁波导行，且上下层的电磁场传输尽管具有空间重叠，但极易实现频率信号分离，具有低串扰的特点。所述第一、第二两个传输层均由多层超构材料单元层叠结构构成，所述超构材料单元层叠结构由多个具备双各向异性特性的超构材料元胞按照一定空间取向并沿着电磁波导行路径进行周期性的阵列排列构成，所述双各向异性超构材料元胞由空气层、介质基板以及不同尺寸参数的人工金属微结构组成。本发明传导不同频率电磁波的空间占位小，易集成。