本发明实施例提供了一种CPLD文件烧录系统及CPLD文件烧录方法，该系统包括：基板管理控制器、USB开关及USB外部接口，其中，基板管理控制器的第一输入端与USB开关的第一端连接，第二输入端外接文件烧录控制信号，输出端与CPLD的输入端连接；USB开关的第二端与USB外部接口连接，控制端与CPLD连接；USB外部接口与存储有待烧录文件的外部设备连接。从而利用基板管理控制器通过USB开关从外部外部设备中提取CPLD对应的待烧录文件，无需对售后人员开放操作，可以在不使用JTAG接口和不往机房终端上传文件的前提下完成CPLD离线烧录，可以有效确保产品机密、杜绝电脑病毒及保障信息安全。