本发明公开了一种电镜二值化图像对比分析方法，其对比分析方法包括以下步骤：A、获取所有要测量帧图位置，并根据背景范围去除背景像素，再对去除背景后的图像进行二值化处理；B、识别图像中所有的线段，合成图像中所有的特征，并计算特征的图像属性；C、把特征转化为颗粒，并对颗粒进行其他处理和分析后，将这些结构化数据储存到数据库；D、选择大颗粒进行X射线分析；E、将图像缩放到一定大小，并转化为灰阶，再计算所有像素平均值。本发明先对图像进行二值化处理，并将特征转化为颗粒，再对大颗粒进行X射线分析，比较像素的灰度后计算哈希值，可有效提高对图像的对比分析效果，从而为人们的使用带来极大的便利。