本发明公开了脑部影像辅助判读报告生成系统及方法，包括影像辅助判读系统，影像辅助判读系统包括系统应用层、接口逻辑层和数据提供层，本发明涉及影像辅助判读技术领域。该脑部影像辅助判读报告生成系统及方法，设定后台数据库，存储报告固定格式模板和学习模板，提高实习医师学习进度的同时，降低带领医师的工作难度，有效降低报告的生成难度，且统一格式填写报告，为后续诊断医师对脑部影像的判断提供便利，并且利用系统应用单元实现困难点报告模板的自动弹出展示，有效保证判读报告的顺利高效生出，利用数据提供层的提供的资料，通过系统应用层为医师提供定制功能，操作方便的使用，为脑部影像报告的发出提供强有力的辅助。