本发明涉及从海刀豆中提取美迪紫檀素的方法及其应用，可有效解决从海刀豆中提取美迪紫檀素的问题，其解决的技术方案是，将海刀豆种皮和藤叶用超微粒粉碎，按照液固比为6︰1的比例加入体积浓度70%的乙醇，室温下超声提取，减压浓缩提取液，得到粗提物，将粗提物用蒸馏水混悬，依次用二氯甲烷、正丁醇萃取，对二氯甲烷部分根据TLC和紫外特征进行分离纯化，得到美迪紫檀素单体化合物，本发明对海刀豆的藤、叶的化学成分进行提取、分离和纯化，并对海刀豆中紫檀素类化学成分的提取和美迪紫檀素抗肿瘤生物活性进行了研究，适合进一步开发成抗肿瘤药物产品，是提取美迪紫檀素的方法及其应用上的创新。