本发明公开了一种从鹰嘴豆芽中制备紫檀烷类化合物高丽槐素和美迪紫檀素的方法，该方法先将鹰嘴豆浸泡，发芽后摘取豆芽使用乙醇水溶液回流提取后，浓缩至无醇味的浓膏，将浓膏用纯化水分散后，上样预装大孔树脂色谱柱，依次使用纯化水、浓度10%的乙醇溶液除杂，再使用95%乙醇水溶液洗脱；将洗脱部分浓缩至无醇味后，使用纯化水分散，再通过乙酸乙酯进行萃取，将所得乙酸乙酯部位浓缩、干燥，得到总异黄酮部位；再将所得部位依次利用硅胶色谱法以及反相色谱法分离，收集流分，分别得到高丽槐素和美迪紫檀素两种紫檀烷类化合物。该方法为制备高丽槐素和美迪紫檀素两种标准样品提供一种简便、易得、快速的方法，也可应用在鹰嘴豆及豆芽等保健食品开发及其质量标准建立的研究领域。