本发明提供一种基于隧道轨行式钻孔机器人的智能化钻孔管理系统及方法，实现对钻孔施工现场的在线实时监测，以BIM模型的可视化性及数据可提取性为基础，基于三维扫描技术优化打孔位置，通过施工模拟优化孔洞作业顺序，提高了施工质量。本发明提出了孔洞信息编码方案，研发孔洞自动编码软件，实现孔洞指向的唯一性及关键建筑信息属性化，将信息转化为数据直接控制作业，与普通钻孔机器人相比，具有自动化程度高、施工效率高、节省人力等优势。本发明采用双坐标系统，实现精确定位钻孔，优化了钻孔质量；本发明中的钻孔定位实现了实物与模型数据实时比对，提高了整体钻孔精确度，并对已完成钻孔反馈数据的差异化进行处理，进一步保证钻孔质量。