本发明公开了一种基于多孔凝胶阵列的细胞培养基质的制备方法，包括以下步骤：配制透明质酸钠溶液，在冰水浴下第一次滴加甲基丙烯酸酐，反应，然后第二次滴加甲基丙烯酸酐，继续反应，反应结束后加入过量的冰乙醇，之后离心处理，收集沉淀，将沉淀重新溶于去离子水中，之后冷冻干燥，制得甲基丙烯酸酯化透明质酸钠；将上述制得的甲基丙烯酸酯化透明质酸钠、重构RGD粘附肽和0.01MOL/L的磷酸盐缓冲液混合搅拌处理，然后加入二硫苏糖醇混合均匀，制得凝胶原液；以装有微柱的聚二甲基硅氧烷为模板，对凝胶原液进行浇注成型，固化后，脱模处理，制得基于多孔凝胶阵列的细胞培养基质。该基质用于细胞培养时可有效改善细胞的粘附与增殖，操作方便。