本发明属于精细化工技术领域，具体涉及单脂肪酸糖酯的合成方法和应用。本发明单脂肪酸糖酯的合成方法，包括如下步骤：在超微孔催化剂催化下，单糖与脂肪酸酯反应，得到单脂肪酸糖酯。本发明提供了一种多相限域催化选择合成单脂肪酸糖酯的策略，通过调节适量碱性以及精准控制孔道结构与单脂肪酸糖酯结构匹配，使单糖与脂肪酸酯在超微孔催化剂窄分布的孔道内进行酯交换反应生成单脂肪酸糖酯，生成的单脂肪酸糖酯通过传质离开孔道进入溶剂本体，在溶剂中由于其表面活性发生分子定向排列形成胶束或“舒张”引起分子动力学尺寸略微增大，使其再难以进入孔道内发生反应，实现对单脂肪酸糖酯的高效选择合成。