本发明公开了一种高铁动车运行车厢，包括厢体、设置于所述厢体内的车座，其特征在于，所述厢体包括相互配合的主车厢、辅车厢，所述车座下方设置有驱动其沿所述厢体宽度方向移动的车座移动装置，所述主车厢、辅车厢相向的一侧均设置有与所述车座对应的升降侧板，所述主车厢一侧设置有与其滑动配合的挡板，所述主厢车厢一侧四角水平设置有与其滑动配合的连接杆，所述辅车厢一侧四角设置有与所述连接杆插接配合的插槽。本发明还公开了一种高铁动车运行系统，通过在主车厢与辅车厢的配合，实现了在不停车的情况下，满足了乘客上下车的需求，提高了高铁或动车的运输速度，提高了高铁或动车的运输效率，节省了乘客的坐车时间。