本申请提供了一种电池组系统的控制方法、装置和储能系统，该方法包括：在主正充电开关、主正放电开关和主负开关均闭合的情况下，获取电池组系统的故障信息，得到故障类型，故障信息为电池组或者对应的高压执行机构出现的故障的信息；根据故障类型控制对应的开关断开，使得续流回路通电，故障类型包括充电故障和放电故障，充电故障对应的开关为主正充电开关，放电故障对应的开关为主正放电开关；在故障消失且电池组的荷电状态的变化量大于第一预定值的情况下，控制故障类型对应的开关闭合。该方法解决了现有技术中电池组系统的可用性差的问题。