过滤酶切建库方式引入噪音的方法和装置
实质审查的生效
摘要
本发明公开了一种过滤酶切建库方式引入噪音的方法和装置。该方法包括：获取酶切建库双端测序下机数据并比对至参考基因组序列，再从中提取含有Soft Clip标记的读段，并统计各读段中Soft Clip碱基数；将Soft Clip碱基数大于阈值T1的读段记为候选处理序列，并提取各候选处理序列的比对位置以及Soft Clip碱基序列；根据各候选处理序列的比对位置前后延伸D长度得到延伸区域，并寻找与Soft Clip碱基序列相似的序列，若相似度大于阈值T2，视为含有酶切噪音的读段存于去除文件中；过滤掉含有的读段，得到去除噪音的比对文件。有效过滤artifact序列，提高检测准确性。
基本信息
专利标题 ：
过滤酶切建库方式引入噪音的方法和装置
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN114334006A
申请号 ：
CN202111649916.6
公开（公告）日 ：
2022-04-12
申请日 ：
2021-12-29
授权号 ：
暂无
授权日 ：
暂无
发明人 ：
蒋才戴鹏程陶然朱文鑫
申请人 ：
纳昂达（南京）生物科技有限公司
申请人地址 ：
江苏省南京市江北新区华康路142号南京生物医药谷加速器三期A01栋南侧3-4层
代理机构 ：
北京康信知识产权代理有限责任公司
代理人 ：
路秀丽
优先权 ：
CN202111649916.6
主分类号 ：
G16B30/10
IPC分类号 ：
G16B30/10 G06K9/62 G06F16/16
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B30/00
特别适用于对核酸或氨基酸进行序列分析的ICT
G16B30/10
序列排列；同源搜索
法律状态
2022-04-29 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 30/10
申请日 : 20211229
申请日 : 20211229
2022-04-12 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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