本发明涉及一种舵面自动偏转机构的偏转角精确定位方法及系统，本发明建立机构的工作平面和虚拟丝杠轴；在工作平面内建立偏转角定位解析式；将定位解析式表达转换到与实际机构输出相关；将机构的结构不确定性，转化为三个待定结构参数的求解问题；控制机构分别进行4次预定动作，测量实际的舵偏角和对应的丝杠行程，根据测量结果求解待定结构参数；用求解后解析式实现偏转角的精确定位；本发明建立偏转角定位解析式，将机构的结构不确定性，转化为三个可以求解的结构参数，并设计易于实现的方法求解，能够实现舵面偏转角的精确连续控制。