本发明公开了一种基于多跳路径的生物医学知识库补全方法及装置，在生物医学知识库中存在着大量的关于疾病、药物和基因等实体的信息，补全知识库中实体之间缺失的关系可以改善许多重要的应用，例如药物设计和再利用。为了对生物医学知识库中缺少的实体关系进行补全，本发明使用了长短时记忆网络对生物医学知识库中存在的多跳路径集合进行编码，注意力机制对多跳路径集合的编码结果进行汇总，实现了实体关系补全。最后在药物和疾病为主的数据集上进行实验，实验结果表明，该方法充分地利用了路径信息，不使用外部工具，具有更好的竞争性。