本申请涉及电化学测量技术领域，尤其是涉及一种电化学微生物快速检测仪及生物探针的修饰方法，其检测仪包括电化学生物传感器、电解池、第一放大模块、第二放大模块、参考模块及模数转换模块；电化学生物传感器包括从下至上层叠设置的共面式三电极、生物探针、固态电介质和多孔膜；电解池有CE、WE、RE三个端口；第一放大模块与CE端口连接，第二放大模块与WE端口连接；参考模块电连接于第一放大模块、第二放大模块以及模数转换模块的输入端；模数转换模块电连接于第二放大模块的输出端。解决了现有微生物检测过程复杂，检测时间长的问题。本申请具有能够快速测微生物，检测灵敏度高，检测操作简单的效果。