本申请涉及微生物检测技术领域，尤其涉及一种微生物检测仪。微生物检测仪包括采集组件、底壳、试剂瓶、检测组件与顶盖；采集组件用于采集微生物样本；试剂瓶用于接收采集组件采集的微生物样本并使其与试剂瓶中的试剂充分接触；检测组件包括光电元件与微处理器，光电元件邻近试剂瓶设置并用于接收自试剂瓶发出的光线，微处理器用于处理分析光电元件的电信号的强弱以区别试剂瓶中微生物的浓度；底壳设置有用于收容所述试剂瓶与所述检测组件的容纳腔；顶盖与底壳盖合连接以密封容纳腔，顶盖包括显示屏，显示屏接收并显示微处理器的分析结果。通过上述方式，本申请实现小型化，缩小体积，便于携带，降低成本。