本申请涉及病理组织处理技术领域，尤其涉及一种实现自动包埋的方法及设备，实现自动包埋的方法包括：步骤1，多个包埋盒位于收纳区域且在竖向上依次堆叠；步骤2，输入机构使最底部的包埋盒和其他包埋盒在竖向上分离，并且输入机构使最底部的包埋盒移动出收纳区域，然后其他包埋盒向下移动至收纳区域的底部；步骤3，将离开收纳区域的包埋盒放置于能够移动的承载机构上，并使得承载机构带动包埋盒沿设定路径移动；步骤4，在设定路径上设置加热区域、滴蜡区域、冷却区域。实现自动包埋的设备包括收纳篮、输入机构、承载机构、包埋机构。本申请能够简化操作步骤，降低劳动强度，提高包埋效率。