本发明公开了一种贵金属纳米颗粒/二氧化硅纳米太空舱复合材料及其制备方法；该制备方法包括以下步骤：步骤1，将贵金属纳米颗粒分散在水中，加入硝酸银与还原剂反应，得到贵金属/银核壳纳米颗粒分散液；步骤2，将分散液滴入水/醇的混合溶剂中，在剧烈搅拌条件下加入两种配体、表面活性剂与氨水，两种配体分别为巯基羧酸配体和分子量大的聚丙烯酸；步骤3，继续加入硅源搅拌，得到太空舱形状的空心纳米复合材料。本发明制备方法简单，条件温和、形貌可控，得到表面具有开口的非对称囊状纳米结构，该材料组成具有生物兼容性和生物安全性，作为纳米药物载体具有很好的前景。