本发明提供了污水中违禁物的溯源方法，所述违禁物包括毒品或其代谢物，所述污水中违禁物的溯源方法为：在污水泵站连续采集污水，并留存；在污水处理厂进口连续采集污水，并获得污水检测结果；若检测结果异常，则发出指令，结果异常前后时间内污水泵站的留存水样保留；收集各个污水泵站的留存水样，并检测，筛查出留存水样异常的污水泵站，并得到与污水泵站对应的异常区域；派出移动检测车，检测所述异常区域内人员的体液或毛发，并留样，从而筛查出可疑人员；在实验室检测留样的体液或毛发，从而实现违禁物的溯源。本发明具有自动化、溯源准确等优点。