本发明公开了一种线路板熔炼有机尾气处理系统，包括熔炼单元、余热单元、冷却单元、活性炭喷射器、布袋除尘装置、脱硫吸收塔和次级脱硝单元，余热单元包括余热锅炉，冷却单元包括喷雾冷却器和温度监测器；沿熔炼单元所产生尾气的流动方向，余热锅炉、喷雾冷却器、活性炭喷射器、布袋除尘装置、脱硫吸收塔、换热器和次级脱硝单元依次连通，并由次级脱硝单元的出气口处排出达标尾气。本发明通过对熔炼炉处尾气温度、余热锅炉处CO浓度、脱硝喷枪处氮氧化物含量的实时监测和调整，配合喷雾冷却器的急速冷却，使线路板熔炼后尾气中的二噁英含量显著降低，处理后的尾气满足排放标准。