本公开涉及一种无线时钟同步方法、装置、系统及存储介质，所述方法应用于从基站，包括：接收至少一个主基站按照预设频率发送的数据帧，数据帧包括帧类型标识和主基站的设备标识，在根据帧类型标识确定数据帧为时钟同步帧的情况下，基于包含相同的设备标识的数据帧，按照预设的评估策略评估至少一个主基站中的每个主基站的时钟质量，进而根据每个主基站的时钟质量，从至少一个主基站中确定出时钟质量满足预设质量条件的目标主基站，向目标主基站订阅时钟信息，以根据时钟信息确定从基站与所述目标主基站之间的时钟差。本方案实现了由基站自身完成时钟同步，并且实现了仅对时钟质量较好的主基站进行时钟同步，能够提高时钟同步的准确度。