本发明公开了一种大数据存储与溯源系统，属于大数据存储领域，技术要点包括基础平台层、数据操作层、系统核心层以及系统接入层；所述基础平台层包括文件系统与存储层，所述文件系统采用kernel bypass结合非阻塞式异步IO，所述存储层用于将数据切片、加密之后的切片文件分布式存储至硬盘内；所述数据操作层包括数据切片模块、数据加密模块与数据操作模块，所述数据切片模块用于在存储之前对数据进行切分，所述数据加密模块用于对切分后的数据即对同一文件的一个及一个以上的分片进行加密。本发明，具备全链路数据监控以及溯源手段，对大数据存储系统中的数据存储安全性进行有效的改进，在数据泄露、隐私保护层面的干预程度较强。