本发明公开了一种医疗数据挖掘及应用系统和装置的数据源接口标准方法，涉及医学数据挖掘技术领域。本发明包括以下步骤：(1)为数据源配置唯一的标识编码；(2)数据源接入系统时，数据源向系统提交标识编码进行认证，系统校验唯一标识编码，并向数据源反馈授权认证状态，若数据源授权。本发明对数据源配置唯一的标识编码，所有的数据源均采用统一标准的标识编码，从而在上传数据过程中，方便MRSS系统对数据源进行核验，且核验通过后的数据源在上传以及查阅数据时，会根据标识编码进行逐步核验，以保证数据源的安全性，同时统一标准的接口便于实现海量数据的接入，使得MRSS系统数据挖掘发现的信息越来越多，可支撑的科研范围、人群越来越广泛。