本发明提供一种核酸自动提取仪及核酸提取方法，包括基架，基架上设有用于放置提取管的试管支撑座，提取管中预先放置有磁棒套和封存有用于核酸提取的试剂；水平移动机构，驱动试管支撑座沿水平方向移动；第一支架，位于试管支撑座的上方，第一支架上固定安装有磁棒；第一竖向移动机构，驱动第一支架沿竖直方向移动；第二支架，位于试管支撑座的上方，位于第一支架的下方，第二支架上设有供磁棒上下穿梭的定位通孔，第二支架底部设有辅助磁棒套脱套的脱套结构；第二竖向移动机构，驱动第二支架沿竖直方向移动；主控板。本发明能在一个装置中实现裂解、漂洗和洗脱过程，洗脱完毕后折下洗脱液试管低温保存或直接取样检测即可，简单、快捷、高效。