本实用新型公开一种箱式污物消毒回收系统，包括用于收集并暂存各楼层污物的污物暂存系统、用于将污物暂存系统内污物传送出去的传输通道系统、用于接收传输通道系统的污物并进行分拣存放的污物分拣库以及用于将分拣后污物进行转运的垃圾运输车，污物暂存系统设置于各楼层上，传输通道系统与污物暂存系统的连接端设置有污物投放终端，传输通道系统内设置有消毒系统。通过污物暂存系统将箱式污物归集、暂存后，利用污物投放终端密封投放至传输通道系统内，并在传输通道系统内进行消毒杀菌处理，使得箱式污物在整个运输途中不断灭菌，最后通过污物分拣库分拣给不同的垃圾运输车，保证了污物流转系统回收过程的无菌化，避免影响外界环境。