本实用新型公开了一种生物镜倒置显微镜，包括底座，所述底座上安装有显微镜主体组件，所述底座上设有位于显微镜主体组件上方的载物台，所述底座在位于载物台的上方设有遮光机构，所述遮光机构经升降机构设置在载物台上方的升降板，所述升降板上设有与载物台对应的通孔，所述升降板在位于通孔的外侧设有遮光罩板，所述升降机构包括设置在底座上的且竖直向上的电动伸缩杆，所述底座上设有与电动伸缩杆平行设置的定位筒，所述定位筒内设有伸缩腔，所述伸缩腔内设有伸缩杆，所述伸缩杆的顶端升降板相固定。本实用新型有效地避免了在进行观察时有外界光线的干扰，而导致观看不清楚。